生物学的同等性とバイオアベイラビリティのジャーナル

概要

HCRTR2タンパク質に対する強力な阻害剤の検出のためのファーマコフォアベースのリード最適化と分子ドッキング分析

マリアム・マクブール*

不眠症は、その有病率が日々増加しており、公衆衛生上の問題として深刻化しています。アジア人の間で最も一般的な睡眠障害の 1 つです。不眠症に苦しむ 10 人に 1 人は不眠症です。すべての睡眠障害のうち、約 6 ～ 10% が不眠症の基準を満たしています。男性に比べて女性に非常に多く見られます。この研究では、薬用植物から効果的な治療を提供するために、潜在的なターゲット ベースの薬剤の特定に焦点を当てています。この研究では、リガンド ベースのファーマコフォア アプローチを使用し、続いて分子ドッキングと仮想スクリーニングを使用しました。毒性クラスの予測には Protox サーバーを使用しました。抗不眠特性を持つ化学成分の分子特性は、Swiss ADME、ADMET プロパティ予測ツール、および Osiris プロパティ エクスプローラー ツールを使用して確認しました。 Osmium basilicum の 4 つの化合物のリガンドベースのファーマコフォアが実行され、リガンド スカウトを使用して Zinc、Princeton、Drug bank ライブラリに対してスクリーニングされ、次に CID NS_013367、NS_005529、NS_007342、NS_011378、および NS_011361 でファーマコフォア適合スコアが高い化合物が選ばれました。NS_011285 がドッキング用に選択されました。 Autodockvena を使用して、目的のターゲット HCRTR2 タンパク質とスクリーニングされた化合物の分子ドッキングを 1 つずつ実行し、最小の結合エネルギーを示す最適な位置と方向角度を示す最適なポーズを選択して、さらに調査を行いました。ドッキング結果は、Pymol と Discovery Studio で分析されました。CID 番号 NS_011285 の化合物は、他の化合物と比較して最適なポーズと 9.4 以上の低い結合エネルギーを持ちます。2D 構造は、MET、VAL、LEU、PHE、および ARG 2D アミノ酸と変異タンパク質 HCRTR2 との相互作用、およびアルキル、Pi-アルキル、Pi-シグマ、および Pi-硫黄などの相互作用の種類を示しています。最終的に、最も優れた薬物類似特性を持ち、不眠症の主な原因である HCRTR2 の活性を阻害する可能性のあるリガンドを特定しました。