生化学と分析生化学

概要

ミトコンドリアゲノム解析とStrix alucoの系統発生と分岐時期の評価

デビッド・スミス1、レナ・ロイ2*

本研究では、 Strix alucoの完全なミトコンドリアゲノムが初めて報告され、全長は18,632 bpでした。遺伝子は37個あり、そのうちtRNAが22個、rRNAが2個、タンパク質コード遺伝子（PCG）が13個、非コード制御領域（Dループ）が2個でした。S. alucoの完全なミトコンドリアゲノムの第二世代シーケンシングは、 Illuminaプラットフォームを使用して実施され、次にTytoninaeを外群として使用し、PhyloSuiteソフトウェアを適用してStrigiformesのMLツリーとBIツリーを構築し、最後にBeast 2.6.7ソフトウェアを使用して分岐タイムツリーを構築し、 Miosurniadiurna化石を含む堆積物の年代（6.0〜9.5 mA）を内部修正ポイントに設定しました。Strixの共通祖先は更新世（2.58〜0.01 mA）に分岐したことが確認されています。中期更新世の秦嶺山脈の劇的な隆起と更新世の気候変動が相まって、中国本土の北部と南部の間でStrixの分岐を引き起こしました。この時期にStrix uralensisとS. alucoの共通祖先が分岐した主な理由は、氷河期と間氷期の循環と氷河避難の孤立でした。本研究は、 Strixの進化の歴史に関する参考資料を提供します。