生化学と分析生化学

概要

動脈硬化を引き起こす病原体に対する推定薬剤標的およびワクチン候補の特定

カニパカム・ヘマ、ヴァニ・プリヤダルシニ1世、ディビヤババ・プラダン、マネ・ムニクマール、スワルガム・サンディープ、スワルガム・サンディープ、ナタラジャン・プラディープ、スチトラMM、アミニニ・ウママヘスワリ

アテローム性動脈硬化症は慢性の炎症性動脈疾患で、世界中で罹患率と死亡率が高く、心血管（心臓）および脳血管（脳）の脳卒中の原因となっています。最近の疫学的研究では、クラミドフィラ・ニューモニエ、ポルフィロモナス・ジンジバリス、ヘリコバクター・ピロリなどの感染性病原体がこの疾患に関連していることが示されています。したがって、これら 3 つの病原体に対する共通の薬物ターゲットとワクチン候補を特定することは、アテローム性動脈硬化症の治療と管理に不可欠です。クラミドフィラ・ニューモニエは、アテローム性動脈硬化症で優位に働くことから、参照生物として選択されました。比較ゲノムアプローチ、サブトラクティブゲノムアプローチ、代謝経路解析、非相同腸内細菌叢解析、ドメイン検索解析を実施し、アテローム性動脈硬化症の病原体に対する 35 の共通の推定薬物ターゲットを特定しました。細胞内局在研究が行われ、UvrABC タンパク質がワクチン候補として特定されました。代謝経路解析により、35 の薬物標的のうち 14 の酵素が、病原体の生存、増殖、および発病に関連する主要な経路に関与しており、生成物を合成する代替メカニズムがないことが示されました。腸内細菌叢解析は、ヒトの細菌叢に影響を与えない薬物標的を特定するために実施されました。特定された 14 の薬物標的について、Pfam および SMART データベースを使用してドメイン検索を実施し、 STRING および Cytoscape v3.2.0 を使用してタンパク質ネットワーク解析を実施しました。本研究で提案された薬物標的とワクチン候補は、感染性病原体によって引き起こされるアテローム性動脈硬化症と闘うための強力な阻害剤とサブユニットワクチンを in silico アプローチで設計するための基礎として役立ちます。