生化学と分析生化学

概要

ヒトα-ラクトアルブミンがDNAとRNAを認識する仕組み

ネビンスキー GA、アリノフスカヤ LI、イヴァニセンコ NV、ソボレバ SE、セディク SE

ヒトα-ラクトアルブミン（LA）は乳腺細胞で重要な機能を持ち、アポトーシスに関与するカスパーゼを活性化します。LA複合体はヒストンとともに腫瘍細胞のDNAと相互作用し、クロマチン構造を損傷します。LAがどのようにDNAを認識し、クロマチンのヒストンおよびDNAと相互作用するかについてのデータはありません。リガンドの複雑性を段階的に増加させるアプローチを使用して、各DNAヌクレオチド単位のヒトLAに対する総親和性への相対的寄与を推定しました。LA DNA結合部位の最小リガンドはオルトリン酸とすべてのdNMPおよびrNMP（Kd=(5.0-43)×10-5）であることが示されました。総親和性への最大の寄与は、すべての（pN）nの3つのヌクレオチド単位で観察され、1>2>3の順序で大幅に減少し、n=4-6では著しく低く、n ≥ 6-7では、-logKdのnへの依存性はすべてプラトーに達しました。二本鎖 (pN)n は一本鎖リガンドと比較して著しく低い親和性を示した。LA に対する総親和性に対する (pN)1-6 各ヌクレオチドリンク (ΔGo) の特定の寄与を特徴付ける熱力学的パラメータが推定された。LA-DNA 複合体の空間モデルが計算された。LA タンパク質配列は、それら自身および DNA との複合体間のクロマチン核相互作用に関与する 5 つのヒストン (H1-H4) の配列と相同性がある。この相同性が LA とクロマチン DNA との相互作用の主な理由であると考えられ、その構造の崩壊、およびヒストン同士および DNA との適切な結合につながる。