生物学と医学

概要

β-サラセミア変異を検出するための全遺伝子配列に基づくスクリーニングアプローチ

スパンダン・チョーダリー、ディパリ・ダワン、ニラージ・ソジトラ、プシュプラジシン・チョーハン、キャティ・チャンドラトル、プージャ・S・チョーダリー、プラシャント・G・バガリ

βグロビン遺伝子には、約200の原因となる変異が特徴付けられています。ベータサラセミアの診断は、世界のさまざまな地理的地域にわたるHBB遺伝子の遺伝的多様性のため、非常に複雑です。本研究では、新たに開発されたシーケンシングとPCRベースのアッセイを使用して、21の無関係な家族（父親、母親、絨毛膜絨毛サンプル/羊水サンプルからのDNAを含むトリオサンプル）からの66件と72件の個人検体を含む138の臨床検体とを分析しました。138のサンプルで11の異なるHBB遺伝子変異が観察されましたが、これらは文献でもインド亜大陸の人口で最も一般的な変異として引用されています。本研究で観察された最も一般的な変異は、HBB.C.92+5 G>C（GC + CC遺伝子型が44.93%と観察された）でした。鎌状赤血球貧血とβサラセミアの形質の共遺伝、双胎妊娠の場合のβサラセミア主要変異の複合ヘテロ接合性など、いくつかの興味深いケーススタディにも簡単に焦点が当てられました。市販のHBB遺伝子の分子診断キットは、標的変異を検出および特定できますが、親の血液および胎児サンプル中のβサラセミアの新規および非標的変異を検出できません。したがって、βサラセミア疾患の完全な診断を提供するには、ギャップPCRアプローチとともに、HBB遺伝子（βグロビン遺伝子）の完全な配列決定を含むスクリーニング技術が必要です。