ゲノミクスとプロテオミクスにおけるデータマイニングのジャーナル

概要

全エクソーム配列解析により、家族性乳がんの相対リスクと相関する、まれな高浸透度変異と低浸透度変異の組み合わせが明らかになった

ベン・レカヤ・マリエム、ハムディ・ヨスル、エル・ベンナ・フーダ、メジリ・ネスリン、ジャイダン・オルファ、アヤリ・ジヘネ、ベン・ナスル・ソニア、ダラリ・ハムザ、メサウド・オルファ、メデブ・リム、ミグリ・ナジャ、ブージェマー・マルア、ブーベイカー・モハメド・サミル、ハダウイ・アブデラゼク、ムラッド・リダ、ブッセンハモウダ、アブデルハク・ソニア、ラビディ・ソウマヤ1

目的:無関係な乳がん (BC) 症例におけるすべての稀な病原性変異と一般的な変異を同時に調査し、特定することを目的とした。

方法:チュニジアで以前に特定された BRCA 遺伝子の頻繁な変異はすべて、がんに罹患した血縁者が少なくとも 3 人いる高リスク家族に罹患した 42 人の女性において、サンガー配列決定によって除外されました。2 つの異なる家族歴を持つ 2 つの無関係な症例が、全エクソーム配列決定のために選択されました。選択された高リスク変異体が確認され、分離分析が行われました。

結果: 3 症例で BRCA2 p.Val1283Lysfs の病原性フレームシフト機能喪失変異体を特定し、2 症例の乳がん罹患症例で BRCA2 p.K3326X のまれなノンセンス変異体と共分離する OGG1 p.Arg46Gln の病原性稀少変異体を特定しました。これらの変異体はチュニジアや北アフリカではこれまで報告されていません。

結論:患者 F1.1 の家族歴と発症年齢の若さは、BRCA2 遺伝子の高浸透度変異 (p.Val1283Lysfs) の存在と相関しています。しかし、患者 F2.2 の発症年齢の高齢化と軽度の表現型は、BC 症例でのみ OGG1 遺伝子の病原性変異 p.Arg46Gln と共分離する BRCA2 の低浸透度変異 Lys3326X の存在の結果です。