植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

翻訳伸長因子遺伝子を使用して、エチオピア、東アフリカ、中央アフリカにおけるコーヒー萎凋病の原因菌であるFusarium xylaroides を特異的に検出し、診断します。

オラル S、オランゴ N、キグンドゥ A、オチュウォ S、アドリコ J、ナンテザ A、マトブ E、ルベガ GW、カゲジ G、ハキザ GJ、ワゴワール WW、ラザフォード MA、オピヨ SO

本研究では、DNA ベースのポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) を F usarium xylarioides (アナモルフ: G ibberrela xylarioides) の特異的検出および診断に適用した最初の報告を示す。Fusarium xylarioides はコーヒー萎凋病 (気管真菌症) の原因物質であり、この病気はウガンダのロブスタコーヒー生産における最も重要な経済的制約となっている。この病原菌には 2 つの系統があり、1 つはロブスタコーヒーに病原性があり、もう 1 つはアラビカコーヒーに病原性があるが、その逆はない。この実験室診断は主に顕微鏡検査に基づいているが、これは時間がかかり、識別力が乏しく、高度な専門知識が必要であり、症状のある宿主植物にしか適用できないため、土壌から病原菌を検出できていない。感染したロブスタコーヒーの木から分離された F. xylarioides からの翻訳伸長因子 1α (TEF-1α) 遺伝子を Fusarium 属特異的プライマーで増幅し、PCR 産物を配列決定した。次に、配列データを使用して特定のプライマーを設計しました。プライマーBLAST産物は、ロブスタコーヒーに病原性の75%とアラビカコーヒーに25%のレースを含むF. xylarioides配列のみに一致することがわかりました。PCRによるin vitroテストでは、プライマーがF. xylarioidesにのみ特異的で、284bp産物を増幅し、F. xylarioidesをすべての近縁種のフザリウムおよびテストされた他の植物病原体と区別できることが示されました。さらに、ウガンダのさまざまな地域からのすべてのF. xylarioides分離株からDNAを増幅し、0.78 ng/µLというわずかなDNA濃度を増幅することができました。