微生物および生化学技術ジャーナル

概要

現場測定とオミクスアプローチを組み合わせて微生物マット生態系の隠れた代謝能力を解明

モハメド・AA・アル・ナジャール

微生物マットは、上層での光合成から最深層でのメタン生成を伴う発酵および有機物分解まで、多様な代謝能力を秘めたユニークな生態系です。微生物マット内の微生物は、環境の変化に応じて代謝を変化させることができるため、極限環境で繁栄することができます。これまでの研究のほとんどは、生息する微生物の行動の変化、特定の生化学的指標、または微生物群集構造の変化を測定することに焦点を当てていたため、微生物のこれらの代謝の柔軟性と能力は過小評価されています。しかし、代謝能力に対する理解を広げるためには、基礎となる分子メカニズムの徹底的な研究を行う必要があります。したがって、採用すべき最良のアプローチは、環境条件の変化に応じて、in situ測定とオミックス解析（すなわち、メタトランスクリプトミクスおよび/またはメタプロテオミクス）を組み合わせることです。