薬理ゲノミクスと薬理プロテオミクスのジャーナル

概要

miRNAレギュロームとmiRNA相互作用ネットワークの包括的理解に向けて

ジョセフ・J・ナルリ、デブマリャ・バー、バスコ・アゼベド、プリータム・ゴーシュ

miRNA は、転写後遺伝子発現の重要な調節因子です。miRNA の調節異常は、多くの疾患、特に癌に対する感受性につながります。上流の転写因子、下流のターゲット、機能的および生物学的プロセス、および疾患調節からなるその複雑な分子メカニズムは、まだ完全には解明されていません。したがって、miRNA 調節ネットワークを包括的に理解することは、その機能を調節し、miRNA 治療薬を開発するために極めて重要です。現在、miRNA レギュロムの部分に関する特定の情報を含むいくつかの独立したデータベースとツールがサイロ化して存在しており、miRNA の分子メカニズムの全体的な理解を妨げています。したがって、miRNA レギュロムの機構からの寄与影響と流出を包括的に理解するために、散在するすべてのデータセットをまとまりのある方法で統合することが重要です。この記事では、miRNA レギュロムと miRNA 相互作用ネットワーク分析ツールの最初の包括的な統合知識ベースである miRegulome に関する事例報告を紹介します。 miRegulome は、miRNA レギュロムの必須分子モジュールを統合プラットフォームに統合します。また、miRegulome から miRNA と疾患の相互作用について説明し、それらを分析するためのグラフ理論戦略を考案します。さらに、miRNA 生物学に関連する多様なデータセットを照合する包括的なデータ分析のための強化されたデータベース リポジトリの次世代設計を提示し、miRNA、遺伝子、転写因子、疾患間の新しい相互作用を予測するための新しいアルゴリズムの開発の必要性と課題を提示します。