ゲノミクスとプロテオミクスにおけるデータマイニングのジャーナル

概要

神奇夫正注射（SFI）がヒト樹状細胞のマイクロRNAに及ぼす影響を研究する

Yuwh H、Sze WH、Yip DMY、Cho SP、Boost WCS、Zhang MV、Fan Z、Ng K、Ng MCH、Yeung JWC、Hung A、H WH、Chong GSL、Lee RLP

方法: この研究では 2 段階のアプローチを採用しました。まず、DC の活性化に関与している可能性のある miRNA を特定するために堅牢な DC 細胞株を使用し、次に実際の生理学的状況に近い単球由来の DC を使用して確認しました。ヒト単球性白血病細胞株である THP-1 細胞は、DC の in vitro 研究に有用であることが以前に示されています。この研究では、381 の既知のヒト miRNA (Sanger miR Base、バージョン 14) の MicroRNA アレイを使用して、SFI によって活性化された DC 内の潜在的な miRNA 候補をいくつか特定しました。次に、アノテーション データベース パイプライン miR Base で取得された計算証拠に従って、相対発現倍数変化が 2 を超える 30 を超える潜在的な miRNA 候補から miR-22、miR-107、および miR-200a を選択しました。これら 3 つの miRNA は、健常者 (n=7) の末梢血単核細胞由来の単球由来樹状細胞 (MDDC) を用いた確認試験において、リアルタイム RT-PCR 定量による定量化により、発現の変化がさらに調べられました。これらの結果は、フローサイトメトリーを使用して MDDC 上の HLA-DR および CD80 の発現レベルと相関していました。結果: 確認結果では、7 つの MDDC サンプル全体で、SFI による miR22、miR107、および miR-200a の発現の一貫した上方制御は示されませんでした。さらに、2 つの異なる希釈度 (それぞれ 1/20 および 1/40) で SFI を処理して 24 時間インキュベートした後の MDDC のテスト結果でも、HLA-DR および CD80 の発現の有意な変化は示されませんでした (p>0.05)。さらに、1/20 に希釈した SFI を 1 時間処理した MDDC、1/20 に希釈した SFI を 4 時間処理した MDDC、および 1/40 に希釈した SFI を 1 時間処理した MDDC では、3 つの mi-RNA の発現と HLA-DR および CD80 の表面発現レベルとの相関は統計的に有意ではありませんでした (p>0.05)。結論: miR-22、miR-107、および miR-200a の miRNA 発現の増加は THP-1 細胞株でのみ確認されましたが、7 つのヒト末梢血サンプルからの MDDC では一貫して示されませんでした。したがって、これら 3 つの mi-RNA が DC 上の SFI プロセス中に本当に重要なエピジェネティック制御因子であったかどうかは不明であり、複数の信頼できる DC ソースを使用してさらに調査する必要があります。