生体分子研究と治療学ジャーナル

概要

ヒト血漿プロテオームの幅を癌細胞株および細菌と比較

アンドレイ・V・リシツァ、エカテリーナ・V・ポヴェレンナヤ、エレナ・A・ポノマレンコ、アレクサンドル1世・アルチャコフ

全ゲノム配列決定により、特定の生物におけるタンパク質をコードする遺伝子の数が明らかになりました。これは、分子の複雑性に関する最初の近似値と見なすことができます。RNA スプライシング、多型、共有結合修飾、分解などの転写後および翻訳後の修飾により、異なるタンパク質種 (プロテオーム) の総数は、タンパク質をコードする遺伝子の数よりもはるかに多くなる可能性があります。2D ゲル電気泳動を使用して、ヒトのプロテオームの幅を推定できます。異なるタンパク質負荷条件下で異なる染色 (染料) で得られたスポットの数から、サンプル内の異なるタンパク質の数を大まかに把握できます。スポット数の染料感度への依存性を判断するために、ヒトの血漿および細胞株と細菌細胞のデータが調査されました。各スポットが異なるタンパク質種を表していると仮定して、スポットと感度の依存性をプロテオームの幅の推定値として適用しました。理論上、1 L の血漿には 175 万個のプロテオフォームがあり、個々の HepG2 細胞には 18,000 種、細菌には 6,700 種が存在します。