薬理ゲノミクスと薬理プロテオミクスのジャーナル

概要

リトアニア国民におけるCVD治療薬への反応に潜在的に重要な稀な変異の有病率

プランキュリス A、ラナ エリス T、アンブロザイティット L、ウクトヴェリテ I、ドマルキエン A I、ブロキエン N、クエ インスキーエン ZA、クエ インスカス V

心血管疾患（CVD）は、ヨーロッパおよび世界中で主な死亡原因の1つです。CVD治療に使用される薬剤の有効性または副作用（ADR）に関連すると考えられる主な要因は、主に低密度共通変異体ジェノタイピングアレイを使用したGWAS研究を通じて特定されています。この研究では、CVD治療に関連するゲノム変異を特定するために全エクソーム配列解析（WES）を実施しました。研究グループには、少なくとも3世代にわたるリトアニア民族であり、同じ民族言語地域に居住するリトアニア人集団の、自己申告による健康な非血縁者98人（男性49人、女性49人）が含まれていました。WESを実施した後、CVD治療に使用される薬剤の有効性または副作用に関連すると報告された55の遺伝子の遺伝子座が、LifeScopeTMおよびANNOVARソフトウェアを使用して分析されました。選択された領域の小さなインデルの分析により、CVD治療を受けた患者の有効性に影響を及ぼしたりADRを引き起こしたりする可能性のある13のエクソンフレームシフトインデルと1つのイントロンスプライス部位バリアントが明らかになりました。CVD治療に重要であると報告された遺伝子では、さまざまな頻度で400を超える潜在的に関連性のあるSNVが検出されました。証拠の強さの分析により、CVD治療に最も関連している可能性が高い14のSNVが特定されました。CYP2D6（rs16947）とADRB1（rs1801253）でCVD治療に非常に重要であることが示されているいくつかの変異アレル、およびCYP2C9とNAT2遺伝子のいくつかの変異の頻度分布は、他のコーカサス人集団とは有意に（p<0.05）異なることが判明し、リトアニア人集団で治療前に薬理ゲノム検査を行うことの潜在的な利点を示しています。この研究はLITGENプロジェクトの下で実施されました。 LITGEN プロジェクト (VP1-3.1-ŠMM-07-K-01-013) は、グローバル補助金措置に基づいて欧州社会基金によって資金提供されました。