ゲノミクスとプロテオミクスにおけるデータマイニングのジャーナル

概要

末期腎疾患における IFN-γ、SOCS1、SOCS3 プロモーター領域のメチル化プロファイル

マイベル・ガッタス、ファトマ・エル・シャーラウィ、ノハ・メスバ、ディナ・アボ・エルマッティ

末期腎疾患（ESRD）は慢性炎症の状態です。DNAメチル化は、遺伝子発現を抑制する可能性のある主要なエピジェネティック修飾です。IFN-γおよびサイトカインシグナル伝達抑制因子（SOCS）は、炎症の必須の調節因子です。今回の研究は、ESRD患者および対照群の末梢血から単離したDNA中のIFN-γ、SOCS1およびSOCS3プロモーター領域のメチル化状態を判定し、このメチル化状態とESRDの臨床的特徴との相関関係を明らかにすることを目的としました。本研究には、96人のESRD患者と、民族、年齢、性別が一致した96人の健康な対照群が含まれていました。研究対象遺伝子のプロモーターメチル化は、メチル化特異的ポリメラーゼ連鎖反応（MSP）を使用して評価しました。ほとんどのサンプルは、IFN-γプロモーターメチル化陽性でした。完全な非メチル化はESRD群（7.3%）でのみ観察され、群間で統計的差異が観察されました（P=0.02）。 IFN-γ の非メチル化は、推定糸球体濾過率 (eGFR) の低下、および血清クレアチニンと総コレステロール値の上昇と関連していた。SOCS1 プロモーターのメチル化については、部分的および完全なメチル化が ESRD 患者でのみ観察された (それぞれ 5.2% と 2.1%)。しかし、対照群ではメチル化は検出されなかった (P=0.014)。SOCS3 プロモーターのメチル化は、患者群、対照群のどちらでも検出されなかった。結論として、IFN-γ および SOCS1 プロモーター領域のメチル化プロファイルは、ESRD の病因において重要な役割を果たしている。本研究は、疾患進行におけるエピジェネティクスの役割を強調している。