感染症と診断ジャーナル

概要

抗原または核酸検査におけるSARS-CoV-2ウイルス培養液および臨床残留サンプルの完全性に対する凍結融解サイクルの影響

ハジラ・ヌール・フセイン、ハリ・ウィークス、デレク・チョウ、ディヴィヤ・ジョセフ、ブルック・ラム、ハイドン・シュー、チューシー・チャン、ケチン・グレッグ、ウェンリー・チョウ*

超低温での保存は、SARS-CoV-2ウイルスを含む多くの種類の臨床検体の長期保存のゴールドスタンダードとなっています。凍結検体は簡単に輸送でき、後で検査することができます。さらに、匿名化された凍結残留検体は、多くの前臨床研究または臨床研究のリソースとなります。したがって、凍結検体を検査する場合、凍結融解サイクル（FTC）がSARS-CoV-2検査のパフォーマンスに悪影響を与える可能性があるかどうかを理解することが重要です。いくつかの初期の研究では、FTCが逆転写リアルタイムPCR（RT-PCRまたはRT-qPCR）のサイクル閾値（Ct）を上昇させ、FTC後のSARS-CoV-2核酸の潜在的な分解を示唆していることが示唆されていますが、他の研究では、FTC後のSARS-CoV-2核酸に大きな変化は報告されていません。さらに、FTCがSARS-CoV-2抗原検査のパフォーマンスに与える影響はほとんど報告されていません。

この研究では、FTC が 2 種類の検査のパフォーマンスにどのように影響するかを調査し、直接比較するために、同じサンプルで核酸検査と迅速抗原検査をペアで実施しました。不活化ウイルス培養液サンプルと臨床残留サンプルの両方が研究されました。結果は、FTC が迅速 SARS-CoV-2 抗原検査のパフォーマンスに及ぼす悪影響は最小限であり、検査結果は FTC 全体でほぼ一貫していたのに対し、RT-PCR の Ct 値は FTC 数の増加とともに増加したことを示しました。さらに、私たちのデータは、核酸検査に関して、FTC 中の SARS-CoV-2 はリン酸緩衝生理食塩水 (PBS) よりもウイルス輸送培地 (VTM) でよりよく保存されることも示しました。