先端化学工学ジャーナル

概要

結晶化条件、タンパク質構造、空間群が構造に基づく医薬品設計に与える影響

オルリー・ディム

アポタンパク質および阻害剤を含むタンパク質の 3D 構造は、構造に基づく薬物設計研究の基礎となり、より強力な薬物を探すためのドッキング手順にも利用されます。X 線結晶構造解析を使用したアセチルコリンエステラーゼ (AChE) およびホスホトリエステラーゼ (PTE) の薬物設計の具体的な例を紹介します。計算によるドッキング薬物設計アプローチと AChE 結晶構造の比較分析により、酵素の活性部位溝内のリガンドの位置は結晶化条件によって影響を受けることが明らかになりました。分光学的証拠および熱安定性の結果は、リガンドの配置におけるこのような違いを裏付けています。これらの結果は、ドッキング手順を使用した構造に基づく薬物設計に影響を及ぼします。また、高度に進化したいくつかの PTE バリアントに結合したアポおよびいくつかのホスホネート (OP) 類似体の 19 個の結晶構造も分析しました。データは、さまざまな PTE バリアントの活性部位への OP の結合モードに関する洞察を提供するだけでなく、タンパク質発現に使用されるタグ、適切な結晶化条件の選択、タンパク質構造と空間群の重要性、および構造に基づく薬物設計に対するそれらの意味を明らかにします。