微生物および生化学技術ジャーナル

概要

トルコの東黒海地域におけるC型肝炎ウイルスの遺伝子型の異なる分布

アジズ・ラマザン・ディレク、カジム・サヒン、イルカイ・バチェチ、ナーセル・ディレク

C型肝炎ウイルス（HCV）は、世界中で約1億7000万～2億人を感染させており、HCVの遺伝子型は特定の地理的分布と関連しています。慢性C型肝炎の遺伝子型の情報は、薬物療法の決定と治療結果にとって重要です。この研究の目的は、私たちの地域におけるC型肝炎ウイルスの遺伝子型の分散を決定することでした。この研究は、HCVに感染したさまざまなクリニックから紹介された42人の患者を対象に実施されました。血清中のHCV RNAレベルは、COBAS AMPLICOR HCV Monitor 2.0を使用して定量化されました。HCVゲノムのNS5b部分にあるRNA依存性RNAポリメラーゼのコドン63～347にまたがる851 bpの断片が増幅されました。PCR増幅は、Quantitect SYBR Green PCRミックスを使用してBioRad DNA Engineで実施されました。精製されたPCR産物は、DYEnamic ET Terminator Cycle Sequencing Kitを使用してABI PRISM 310 Genetic Analyzerアプライアンスで表現的に配列決定されました。私たちの研究で最も多く見られた遺伝子型はタイプ1b（90.4%）でした。他のタイプでは、タイプ3と4が検出されました。トルコの他の地域で報告されたレポートとは異なるため、この地域のHCV遺伝子型の分布は厳密に追跡する必要があると考えています。