水産養殖研究開発ジャーナル

概要

マイクロサテライトによる淡水エビ類マクロブラキウム・ローゼンベルギイの遺伝マーカーの開発と応用

シリパヴィー・チャロンワッタナサック、ラクポン・ペトカム、アルニーポン・スリサタポム、ポーンテープ・ニアンフィタク

本論文では、淡水産オオエビ（Macrobrachium rosenbergii）のマイクロサテライトプライマーの開発について報告します。このプライマーは、この種のエビのゲノムライブラリとビオチン化プローブを使用して、塩基配列の繰り返しを持つ 6 種類の DNA フラグメント（(AG)10、(TG)10、(CAA)10、(CAG)10、(GAT)10、(TAC)10）を分離しました。マイクロサテライトを含む 4 つのクローン（SH2-9F、SH2-10C、SH2-11D、SH3-11G）が選択されました。塩基配列解析ではマイクロサテライト配列は見つかりませんでした。4 組のプライマー（それぞれ DTLSH 7、DTLSH 8、DTLSH 9、DTLSH 12）が設計されました。これらのプライマーをオオエビの DNA でテストしたところ、DNA バンドのサイズはそれぞれ 205 bp あたり 131、174、210、193 であることがわかりました。開発されたマイクロサテライトプライマーは、他の種類のエビのプライマーと組み合わせて使用​​できます。タイのオオエビの遺伝的多様性を調べたところ、タイの個体群は 2 つのグループに分類できることがわかりました。1 つはコンケン県、サムットソンクラーム県、アーントーン県の個体で、もう 1 つはスラタニ県の個体と比較して、これら 3 県の個体と遺伝的特徴が似ています。