植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

パナマ病を制御する殺菌剤開発の潜在的ターゲットとしての 5´ â†' 3´ エキソリボヌクレアーゼ 2

マルドナド ボニーラ LD およびカルデロン オロペザ MA

Fusarium oxysporum f. sp. cutense Tropical Race 4 の発生は現在、世界中のバナナ生産を脅かしています。商業用バナナ植物はクローン性であるため、耐性品種を選択することは現実的ではないと思われます。そのため、作物保護の代替アプローチを開発する必要があります。5´ → 3´ エキソリボヌクレアーゼ XRN2/RAT1 は、5´ → 3´ RNA の分解に関与しています。XRN2 および条件付き変異体を用いた真菌研究では、この酵素の重要な役割が示されており、パナマ病を制御するための殺菌剤として使用できる新しい阻害剤を探すためのターゲットとして XRN2 を検討する必要があることが示唆されています。Tropical Race 4 XRN2 (FocTR4XRN2) の in silico 解析により、5´ → 3´ エキソリボヌクレアーゼの特徴、たとえば 5´ 一リン酸化 RNA を認識し、モノヌクレオチドの処理済み切断を触媒する触媒ドメインが明らかになりました。基質取り込みの可能性を示す限定された空洞は、その活性を阻害する可能性のある小分子と相互作用する傾向があるようです。FocTR4XRN2 の触媒ドメインには CCHC モチーフがあり、これは糸状菌の相同タンパク質では保存されていますが、酵母には存在しません。ピロホスホヒドロラーゼ RAI1 との相互作用に関与する残基も保存されています。分子ドッキングにより、FocTR4XRN2 と天然阻害剤アデノシン 3', 5' ビスリン酸との潜在的な相互作用が明らかになり、このアプローチはパナマ病の原因物質の進行を抑制するのに役立つ可能性のある新しい酵素阻害剤をスクリーニングするのに信頼できるものであることが示唆されています。