ゲノミクスとプロテオミクスにおけるデータマイニングのジャーナル

概要

ジャーリア炭層盆地におけるメタン生成のギャップを埋める共栄養生物

プリヤンカ ジャー 1,5*、スジット ゴーシュ 1,2 $、クナル ムコパディヤイ 1、アシシュ サッチャン 1、アンバリッシュ S ヴィディヤルティ 3,4

インド最大のCBM生産地であるジャールカンド州のジャーリア盆地では、瀝青質および亜瀝青質の石炭が生産されています。ジャーリアのメタン生成については多くの報告がありますが、本研究では、水素栄養メタン生成の触媒として働くことができる共生微生物に特に重点を置いています。メタゲノムアプローチとそれに続く454パイロシーケンスを使用して、ジャーリア炭層盆地の地層水サンプルから共生コミュニティの存在が初めて解明されました。アセンブリされていないクリーンなメタゲノムシーケンスの分類学的割り当ては、MG-RASTサーバーを介してGenBankデータベースに対してBLASTXを使用して実行されました。クラスclostridiumは、ファミリーSyntrophomonadaceaeに、クラスDeltaproteobacteriaはファミリーDesulfurocacteraceae、Pelobacteraceae、Syntrophaceae、およびSyntrophobacteraceaeにシーケンス所属していることが明らかになりました。結果は、シントロフォテルムス属に関連する共栄養生物の存在により、石炭層での熱生物メタン生成の可能性を明らかにした。このようなコミュニティの存在は、石炭からメタンへの生体変換を助け、エネルギー生産の強化につながる可能性がある。