遺伝子テクノロジー

概要

小さなRNAのクローニングにおける戦略とベストプラクティス

慧大、顧偉鋒

ハイスループットシーケンシングは、主にその感度と利便性から、核酸を分析するための標準的かつ強力なツールとなっています。スモールRNAは、細胞やウイルスの遺伝子の制御に重要な役割を果たしています。スモールRNA分析の従来の方法は面倒で、多くのスモールRNA種に対して精度、特異性、感度が欠けていることがよくあります。そのため、ハイスループットシーケンシングはスモールRNAを分析するための不可欠なツールになります。しかし、スモールRNAは通常、極めて低いレベルで発現し、ライブラリ構築に影響する修飾を含むことが多く、通常は偏った読み出しを引き起こすため、ハイスループットシーケンシング用の信頼性が高く代表的なスモールRNAライブラリを生成することは困難です。このレビューでは、高品質で信頼性の高いスモールRNAライブラリを生成するためのさまざまな戦略を比較し、ハイスループットシーケンシングRNAライブラリを準備するためのベストプラクティスに関する推奨事項を示します。