細菌学および寄生虫学ジャーナル

概要

MALDI-TOF 質量分析法による固体および液体培養培地からの細菌および真菌の種の同定

マルコ・ライヒ、フィリップ・P・ボスハルト、マイク・スターク、クルト・ベイザー、ステファン・ボルグマン

過去数年の間に、MALDI-TOF質量分析は、培養された細菌や真菌の種の同定のための強力なツールになりました。本研究では、商用のハイスループット研究室でのMALDI-TOF質量分析の実装について説明します。さまざまな成長条件が同定結果に与える影響を評価しました。血液寒天培地でさまざまな期間（5、18、24、48時間）培養した大腸菌株と黄色ブドウ球菌株のMALDI-TOFスペクトルにわずかな違いが見られましたが、すべての期間で信頼性の高い種の同定が得られました。大腸菌株と黄色ブドウ球菌株をさまざまな固体培地で18時間培養した場合も同様でした。真菌を固体および液体培地（サブローブイヨン）で培養した場合も、信頼性の高い同定が達成されました
。さらに、ブイヨンで真菌を増殖させると、同定が加速されました。MALDI-TOF質量分析により、陽性血液培養サンプルからの微生物の信頼性の高い同定も可能になりました。合計で、主に臨床サンプルに由来する 2,900 の標本 (234 の異なる種) が検査されました。微生物は、固体培地、血液培養ボトル、液体サブローブイヨンで培養されました。MALDI-TOF 識別結果の 98.6% (n=2,860) は、従来の方法 (グラム染色、炭水化物分解能力、フェニックスシステムなど) および 16S rDNA PCR 産物の配列決定の結果と一致しました。不一致は主に、分析システムのデータベースに参照スペクトルが欠落していることに基づいています。この研究は 2009 年に実施されました。データベースは継続的に改善されているため、今日この研究を実施すると、さらに高い精度が達成されるでしょう。要約すると、臨床のハイスループット環境で MALDI-TOF 質量分析を使用すると、真菌の培養用のブイヨンなど、さまざまな培養条件が使用された場合でも、信頼性の高い結果が得られます。 MALDI-TOF 質量分析法は高速かつ堅牢な識別システムであり、ハイスループット研究室における微生物の識別の新たな標準になりつつあります。