遺伝子テクノロジー

概要

sdRNA: 効率的かつ標的遺伝子特異的なRNA干渉のためのDNAシード付きsiRNA

ウイテイ クミコ

RNA干渉（RNAi）は、小さな干渉RNA（siRNA）が配列特異的な転写後遺伝子サイレンシングを誘導するプロセスであり、機能ゲノム学だけでなく治療用途にも強力なツールとして広く認識されています。正確な標的遺伝子機能と治療用途の成功を達成するには、効率的で標的遺伝子特異的な方法を選択する必要があります。

オフターゲット効果が最小限の siRNA。意図しない遺伝子にオフターゲット効果を誘発する能力は、シード領域 (siRNA ガイド鎖の 5' 末端から 2 ～ 8 番目の位置) とターゲット mRNA の間で形成される二重鎖の熱力学的安定性と強く相関していることが分かりました。この特性と一致して、ガイド鎖の 5' 近位 8 ヌクレオチドにデオキシリボヌクレオチド、パッセンジャー鎖に相補ヌクレオチドを持つ DNA-RNA キメラ siRNA (chiRNA) は、シード-ターゲット塩基対形成における DNA-RNA 二重鎖の安定性が低いため、実質的にオフターゲット効果を及ぼさないことがわかりました。ただし、主要なターゲット遺伝子に対する対応する RNAi 活性も、DNA 置換によって平均で 10 分の 1 に減少しました。ここでは、シード領域のみに 7 つのデオキシリボヌクレオチドを持つ siRNA (sdRNA) は、効率的な標的特異性を示す可能性があるが、オフターゲット効果によって RNAi 活性が低下する可能性があることを報告します。