微生物および生化学技術ジャーナル

概要

シリカカラムによる精製に基づく2つの市販方法を用いた酵母カンジダ・パラプシロシス・センス・ストリクトからのRNA抽出

ロドリゲス ML、ローザ AC、ジュトゥコビッチ VM

遺伝子発現を研究するには、良質の RNA を得る必要があります。これまでにさまざまな RNA 抽出法が発表されていますが、RNA の品質と収量は、さまざまな手法や生物学的研究の対象となる種によって異なる場合があります。現在までに、カンジダ属酵母からの RNA の抽出と精製の標準化された方法はありません。この主題に関する数少ない論文は主に糸状菌に関するもので、手動または社内 IVD 法に基づく抽出法では良い結果が得られていません。したがって、この研究の目的は、モデル生物としてカンジダパラプシロシス センス ストリクトを使用し、シリカ カラム (Qiagen および Zymo Research) を使用する 2 つの市販の RNA 抽出および精製システムを比較することです。この酵母は、最近の論文で、口腔内で 2 番目に頻繁に分離されるカンジダ種であると特定されています。過去 10 年間、成人と未熟児の両方におけるカンジダ血症の主な原因の 1 つであるため、医学的な関心が高まっています。このような背景から、カンジダパラプシロシスの厳密な意味でのトランスクリプトームと環境の変化によるその変化を研究することが優先事項であると考えています。この実験研究では、19 の菌類分離株を Qiagen で処理し、17 の分離株を Zymo Research で処理しました。結果は、Qiagen 溶解バッファー RLT が、より高品質の RNA 製品を得るために不可欠であることを示唆しています。