植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

Rep-PCR ゲノムフィンガープリンティングにより、インゲンマメ ( Phaseolus vulgaris L.)の病原菌Pseudocercospora griseolaのエチオピア分離株の遺伝的多様性と集団構造が明らかになりました。

ヤイス・レゼン、カサフン・テスファイ、ムカンクシ・クレア、アラン・マレ、ポール・ゲプツ

角斑病（Pseudocercospora griseola）は、エチオピアのほとんどの地域でインゲンマメ生産に影響を及ぼす最も壊滅的な病気の1つです。したがって、耐久性のある耐性を持つインゲンマメ品種の使用は、最も効果的で経済的な防除手段です。病原体集団の遺伝的変異性と集団構造に関する知識は、インゲンマメ改良プログラムを成功させる上で重要です。本研究の目的は、エチオピアの多様なインゲンマメ栽培地域の現地調査コレクションから得られたP. griseola分離株間に存在するゲノム多様性を決定することでした。本研究では、DNA配列多様性のフィンガープリントに反復遺伝子外回文要素-ポリメラーゼ連鎖反応プロトコルを使用しました。遺伝的多様性を研究するために、P. griseola病原体の79の単一胞子分離株からの分子データを分析しました。したがって、分子分散分析（AMOVA）とクラスター分析により、 P. griseola分離株内および分離株間に高い遺伝的多様性が存在することが明らかになりました。 ERIC PCR は 21 種類の異なるクラスター パターンを生成しましたが、REP-PCR と BOX PCR はそれぞれ 11 種類と 5 種類の異なるクラスター パターンを生成しました。これは、同じ BOX パターンを共有する分離株の一部が、ERIC と REP のフィンガープリント パターンによって区別できるためです。ERIC、BOX、および REP-PCR を組み合わせたフィンガープリント パターンは、カットオフ 77% の遺伝的類似性マトリックスで生成された 79 の単胞子性P. griseola分離株間で 25 種類の異なるパターンを識別しました。これらの識別されたクラスターは、エチオピアの多様なインゲン豆栽培地域から収集されたP. griseola分離株内および分離株間で遺伝的多様性が存在することを明らかにしました。