植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

ルテオウイルスとPAV-大麦黄萎ウイルスの関係

ホダ MA ワジリ*、ハラ A アミン、KE セイカー、AM ソリマン

エジプトで栽培された小麦植物から分離された大麦黄萎ウイルス (BYDV-PAV) の特性が明らかになりました。オープン リーディング フレーム (ORF1) にあるポリメラーゼ遺伝子 (P1) とオープン リーディング フレーム (ORF3) にあるコート タンパク質遺伝子 (CP) の、大麦黄萎ウイルス (BYDV-PAV) 分離株の 2 つのコード領域がターゲットになりました。Genbank の BYDV-PAV 分離株に従って、2 セットの特定のプライマーが設計されました。BYDV-PAV のエジプト分離株の ORF1 と ORF3 の DNA フラグメントがクローン化され、配列が決定されました。配列には、ウイルスのポリメラーゼ遺伝子 (P1) をコードする全長 ORF1 が含まれていました。これは 910 ノットの長さで、303 アミノ酸の予測ポリペプチド鎖をコードし、M(r) は 34.67 です。一方、ウイルスコートタンパク質をコードする ORF3 の配列データから、長さが 603 bp で、分子量が 21.96 KDa の 200 アミノ酸のタンパク質をコードしていることが明らかになりました。ただし、エジプト分離株 Egy-Wz と NCBI GenBank で入手可能な分離株の多重配列アラインメントに基づく系統相同性樹では、ポリメラーゼ遺伝子 (P1) がアミノ酸およびヌクレオチドレベルでそれぞれ 05GG2、PAV 014、および PAV014、PAV-Aus 分離株と 76.5%～99% および 71.6%～93.2% の配列同一性を共有していることが明らかになりました。一方、コートタンパク質遺伝子（CP）は、アミノ酸レベルとヌクレオチドレベルで、2つの分離株06KM14と05GG2とそれぞれ85.1%～99.5%および89.7%～99.2%の配列類似性を示しました。