植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

リアルタイムPCRを用いた土壌および植物サンプル中のFusarium udumの迅速な検出と定量

スクマール メサポグ、バンダマラヴリ キショア バブ、アチャラ バクシ、ソマサニ S. レディ、サンギータ サクセナ、アロック K. スリヴァスタヴァ、ディリップ K. アローラ

キマメの維管束萎凋病を引き起こす Fusarium udum を検出するリアルタイム PCR ベースのアッセイが開発されました。F. udum のヒストン 3 遺伝子をターゲットにして、種特異的なプライマーとプローブを設計しました。さまざまなサンプルから F. udum を検出および定量するための信頼性と再現性のある手順を開発するために、比較研究を行いました。オリゴヌクレオチドの感度と特異性は、ドット ブロット ハイブリダイゼーション、標準およびリアルタイム PCR アッセイによって評価されました。プローブ HFUSP は、F. udum の純粋培養から得られた DNA に対して、環境 DNA サンプルの DNA に対して高い感度を示しました。qPCR アッセイは、F. udum を Fusarium の近縁種、他の試験微生物、および環境サンプルと明確に区​​別しました。84.17 の単一の融解曲線と 200 bp の単形性バンドは、PCR アッセイの特異性と信頼性を示しています。このように、リアルタイムPCR法は、複雑な環境から微量のF.udumを検出できる迅速かつ効果的な方法として使用できます。したがって、本研究で実証されたリアルタイムPCR法は、キマメ維管束萎凋病の早期感染および疾病疫学におけるF.udumの検出とモニタリングに効果的に使用できます。