水産養殖研究開発ジャーナル

概要

シアノバクテリアの生体分子ハパリンドール-T の標的を理解するための大腸菌の感受性および耐性分離株のプロテオーム解析

マノージ クマール トリパティ、マヒープ クマール、ディーパリ S、ラヴィ クマール アスタナ、スバシャ ニガム

大腸菌を用いたターゲットには、ニーム樹皮に生息するシアノバクテリア Fischerella sp. 由来の広範囲スペクトルのバイオ分子 Hapalindote-T を使用しました。大腸菌の Hap-TS (感受性) および Hap-TR (耐性) の細胞抽出物を 2DGE にかけました。発現が変化したタンパク質スポット (選択) を LC-MS で分析しました。得られたデータは大腸菌のデータベースと照合されました。発現レベルが変化したタンパク質が 17 個見つかりました。Hap-TS 株で見つかった 3 つの膜タンパク質、OmpP、Agn43A、および LysU は、Hap-TR 株には存在しませんでした。しかし、AspA、GlpK、LpdA、HslU、GlnA、SucB、YihT、GalF、MDH、RfbB、RmlB、AcrAB、FabB、GapA の 14 種類のタンパク質は、細胞の特定の代謝経路に関連し、Hap-TR 株の抽出物で過剰生産されていました。スクリーニングされた 17 種類のタンパク質は、大腸菌の膜タンパク質 (Omp P) を含む重要な代謝経路に関連していました。結果は、これらのタンパク質が大腸菌の耐性の原因である可能性があることを示しました。これらの結果は、耐性株で過剰生産されたタンパク質/酵素は、Hap-T ストレス下での生存戦略である可能性があり、新薬開発のためのシグネチャー タンパク質として使用できる可能性があることを示唆しました。