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概要

SARS-CoV-2ゲノムにおける個々の遺伝子の変異頻度の予備的推定

ウェンファ・ン*

ウイルスにおける進化的選択圧やエラーを起こしやすいポリメラーゼの存在は、より感染性の高い、またはより致死性の高い変異体の出現につながる。しかし、異なる遺伝子はウイルスの病原性プロセスにおいて異なる機能のタンパク質をコードしているため、異なる進化的選択圧を受ける。これは必然的に、ウイルスの進化とそれに伴う病原性の可能性に影響を与える異なる変異頻度につながる。本研究では、欧州ヌクレオチドアーカイブに寄託された10個の組み立てられたゲノムを使用して、SARSCoV-2ゲノム内の各遺伝子の変異頻度の予備的な推定値を決定しようとした。結果から、5つの遺伝子がよく変異することが明らかになった。具体的には、これらの遺伝子は、RNA依存性RNAポリメラーゼ、スパイクタンパク質、ORF3a、ORF8、およびヌクレオカプシドタンパク質である。特に、RNA依存性RNAポリメラーゼとスパイクタンパク質の変異頻度は90%で最も高く、次いでORF3a (30%)、ヌクレオカプシドタンパク質 (20%)、ORF8タンパク質 (10%) となっている。全体として、ウイルスゲノム内の各遺伝子の変異頻度を推定することは、病気の重症度と遺伝子型の相関関係やウイルスの疫学的プロファイルを理解する上で重要な知識を提供します。本研究で実施された SARS-CoV-2 でのそのような取り組みにより、スパイクタンパク質と RNA 依存性 RNA ポリメラーゼの変異率が最も高く、世界各地で懸念される変異体が頻繁に出現していることと相関していることが明らかになりました。

免責事項: この要約は人工知能ツールを使用して翻訳されており、まだレビューまたは確認されていません