ゲノミクスとプロテオミクスにおけるデータマイニングのジャーナル

概要

H5N1 および H1N1 NS1 タンパク質に対するマイクロ RNA の予測: 特定の治療法開発のためのシーケンスの窓

パンカジ・コパルデとシャイルザ・シン

動機:従来のインフルエンザ治療薬は、インフルエンザ抗原タンパク質の非常に多様な性質のために、効果が発揮されない可能性があります。シーケンス特異的治療薬のコンピューターによる予測は、時間がかかりにくく、費用対効果に優れています。ほとんどの miRNA ターゲット予測プラットフォームは、予測の特異性と感度が異なります。ここでは、鳥インフルエンザ H5N1 ウイルスの非構造タンパク質 1 と豚インフルエンザ H1N1 ウイルスのセグメント 8 に対するマイクロ RNA を予測するためのバイオインフォマティクス アプローチを提案します。

結果: hsa-miR-138、hsa-miR-525-5p、hsa-miR-124 は、H5N1 ウイルスの NS1 タンパク質に対する潜在的な配列特異的治療薬として選別されました。異なる H1N1 セグメント 8 ゲノムに関する同様の研究により、抗インフルエンザ薬として使用できる miRNA が予測されました。予測されたマイクロ RNA は、宿主細胞の制御プロセス、MAPK 経路、mTOR 経路などのストレス関連経路にも役割を果たしており、がん関連経路にも関与していることがわかりました。