ゲノミクスとプロテオミクスにおけるデータマイニングのジャーナル

概要

Tegenaria agrestis（ホボスパイダー）の麻痺性殺虫毒素（ITX-1）の 3D 構造予測

AGIngale と NJChikhale

麻痺性殺虫毒素 (ITX-1) (Tegenaria agrestis) には、免疫系を誘導して強化し、宿主を感染から守るための複数の抗原成分が含まれています。受容体に対するナノモル親和性を持つクモペプチド毒素は、イオンチャネルの生理学的役割を理解するための有望な薬理学的ツールであり、イオンチャネル関連疾患の新規治療薬および戦略の開発の糸口となります。Tegenaria agrestis (ホボスパイダー) の麻痺性殺虫毒素 (ITX-1) の 3 次元モデル (3D) が開発されました。構造の予測には、ホモロジーモデリング法を使用しました。モデリングでは、mGenTHERADER によって、Clostridium acidurici の FERREDOXIN (1FCA) の高解像度 X 線結晶構造であるテンプレートタンパク質が得られました。テンプレートタンパク質を比較することにより、比較モデリングプログラムである MODELLER を使用して、ターゲットタンパク質の大まかなモデルが構築されました。このモデルは、PROCHECK や WHAT IF などのタンパク質構造チェックツールを使って信頼性を検証しました。このようにして議論された情報は、麻痺性殺虫毒素 (Tegenaria agrestis) の分子理解への洞察を提供します。予測された 3D モデルは、ウェット ラボでタンパク質の特性評価にさらに使用される可能性があります。