植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

ポリメラーゼとコートタンパク質遺伝子が小麦黄萎ウイルスの標的となり特徴づけられ、推定されたアミノ酸がGenbankのグループメンバーと比較された。

ホダ・ワジリ*

エジプトで栽培された小麦植物はウイルスのような症状を示します。RT-PCR 技術を使用して、小麦黄色萎縮病の特性が調べられました。オープン リーディング フレーム (ORF1) にあるポリメラーゼ遺伝子 (P1) とオープン リーディング フレーム (ORF3) にあるコート タンパク質遺伝子の、小麦黄色萎縮ウイルス (WYDV-PAV) 分離株の 2 つのコード領域がターゲットになりました。Genbank
の BYDV-PAV 分離株に従って、2 セットの特定のプライマーが設計されました。BYDV-PAV のエジプト分離株の ORF1 と ORF3 の DNA フラグメントがクローン化され、配列が決定されました。配列には、ウイルスのポリメラーゼ遺伝子をコードする全長 ORF1 が含まれていました。これは 910 nt の長さで、303 アミノ酸の予測ポリペプチド鎖をコードし、M(r) は 34.67 です。一方、ウイルスコートタンパク質をコードする ORF3 の配列データから、長さが 603 bp で、分子量が 21.96 KDa の 200 アミノ酸の予測タンパク質をコードすることが明らかになりました。ただし、エジプト分離株 Egy-Wz と NCBI GenBank で利用可能な分離株の多重配列アラインメントに基づく系統相同性樹では、ポリメラーゼ遺伝子がアミノ酸およびヌクレオチドレベルでそれぞれ 05GG2、PAV 014 および PAV014、PAV-Aus 分離株と 76.5%～99% および 71.6%～93.2% の配列同一性を共有していることが明らかになりました。一方、コートタンパク質遺伝子は、アミノ酸およびヌクレオチドレベルでそれぞれ 06KM14 および 05GG2 の 2 つの分離株と 85.1%～99.5% および 89.7%～99.2% の配列類似性を示しました。