ゲノミクスとプロテオミクスにおけるデータマイニングのジャーナル

概要

MALDI-MS 用プロテオームイオン液体マトリックスの物理化学的特性

ハニ・ナセル・アブデルハミド

イオン液体マトリックス (ILM) は、マトリックス支援レーザー脱離イオン化質量分析 (MALDI-MS) を使用したタンパク質分析に大きく貢献し、大幅な改善を示しました。これらの材料の物理化学的特性は、ILM の性能を理解し、効果的な ILM を設計するために重要です。本研究では、ILM の化学構造と物理化学的特性の関係を示しました。2,5-ジヒドロキシ安息香酸 (DHB) と 3,5-ジメトキシ-4-ヒドロキシ桂皮酸 (シナピン酸、SA) と呼ばれる 2 つの一般的な有機マトリックスの異なる有機塩基を計算しました。2 つのシリーズは、モル屈折率、モル体積、パラコール、屈折率、分極率、および表面張力について同じプロファイルを示しました。ただし、シナピン酸に基づくイオン液体は、屈折率と表面張力を除くすべてのパラメーターで DHB よりも高い値を示しました。これらのパラメーターは、DHB-IL と比較して SA-IL がタンパク質分析で高い性能を発揮する理由を説明している可能性があります。現在の結果は、ILM の新しい設計を探している人にとって重要です。