微生物および生化学技術ジャーナル

概要

異なるヘリコバクター・ピロリ菌株の系統発生は、株間で遺伝子配列の類似性が高いため、16S rRNA遺伝子では説明できない

ウェンファ・ン

ある種の異なる株の進化的関連性を理解することは、病気の診断や治療に役立つ可能性のある株固有の違いを特定するのに役立ちました。通常、このような株レベルのタイピングは、DNA配列決定や系統樹解析などの分子アッセイによって強化されます。この研究では、ヘリコバクター ピロリのさまざまな株の16S rRNA遺伝子配列に関する公開データを利用して、さまざまな株の進化の軌跡を説明する系統樹をプロットします。多重配列アライメントの結果から、株間で16S rRNA遺伝子配列の高度な保存性が明らかになりました。これは、1つの外れ値の株を除いて、さまざまな株の進化的関係が非常に近いことを示唆する系統樹構造に変換されます。外れ値の株の場合でも、他の同類との進化的距離も大きくありませんでした。全体的に、この研究で得られた結果は、16S rRNA 遺伝子が、同じ種の異なる株間の株レベルの系統発生を捉えていない可能性があることを示しており、この種の他の遺伝子におけるこの系統発生効果を解明する取り組みが必要であることを示しています。このような遺伝子は、ヒトの病原性における毒性に関与している可能性があり、そのため、より高い進化圧力と自然選択を受ける可能性があります。