細菌学および寄生虫学ジャーナル

概要

イラク、アルクート/ワシト県の健康な男性と女性から分離された優勢な糞便性大腸菌の系統分類

サレア MG アル マヤヒ、アラー AM アル カファジ、ヌーハ AS ドシュ、アッセル RK アル レカビ、アーラム GN アル アタビエ

大腸菌の糞便分離株は、A、B1、B2、D と名付けられた 4 つの主要な系統群に分けられます。ほとんどの共生菌株はグループ A に属し、腸管外病原性大腸菌株 (ExPEC) よりも毒性因子が少なくなっています。この研究は主に、PCR ベースのプロトコルを使用して、イラクのワシト州アルクート市の健康な男性と女性から採取した共生糞便大腸菌分離株の系統分類を目的として設計されました。また、これらの分離株から ExPEC の毒性遺伝子が検出されました。この研究で含まれた分離株（n=205）のうち、グループAが雌雄両方の分離株で最も多く（それぞれ68.5%対63.0%）、続いてグループB1（それぞれ15.7%対22.6%）、D（それぞれ10.7%対9.5%）、B2（それぞれ4.1%対4.7%）でした。系統発生グループの性別分布は、雌と雄の間に有意差がありませんでした。雌と雄の分離株は、検出されたExPECの毒性遺伝子のすべてで有意差はありませんでしたが、papCは雄の分離株（16.6%）の方が雌の分離株（6.6%）よりも有意に（P ≤ 0.05）多く見られました。女性と男性の分離株の両方において、最も多くみられた毒性遺伝子は fimH (それぞれ 97.5% 対 100%) と iucC (それぞれ 52.0% 対 55.9%) であり、最も少なくみられたのは sfa/foc (それぞれ 0%) と hly (それぞれ 0.82% 対 0%) であった。さらに、毒性遺伝子はグループ B2 に密集した分離株に集中していた。
女性と男性の両方において、アルクート市のイラク人から得られた優勢な糞便中大腸菌分離株は、系統群 A に密集し、続いてグループ B1 と D に密集していたが、グループ B2 はまれであった。また、ExPEC 特性を持つ優勢な糞便株の普及率ははるかに低かった。