ファリハ アルターフ*、アッバス ムハンマド
肺炎球菌(S. pneumoniae)はヒトの病原体であり、世界中で死亡率と罹患率の主な原因となっています。肺炎球菌は、中耳炎、肺炎、髄膜炎、菌血症の原因物質です。子供、高齢者、免疫力が低下した患者は、これらの細菌に感染するリスクが高くなります。莢膜多糖体の免疫化学によると、S. pneumoniae は90 を超える血清型に分かれています。S. pneumoniaeには、表面タンパク質 A、ニューモリシン、ヒアルロン酸リアーゼなど、多くの表面タンパク質が存在します。莢膜は肺炎球菌の主な毒性因子であり、宿主の免疫系による細菌の貪食を防ぎます。いくつかの抗原決定基は、さまざまな臨床試験や実験で防御免疫応答を促す可能性についても研究されています。S. pneumoniaeの集団生物学は十分に理解されていません。問題のほとんどは、分子特性、保菌者およびさまざまな肺炎球菌性疾患の開示者から十分にサンプリングされた集団によって生じます。これに対処するために、295 の分離株から 7 つのハウスキーピング遺伝子座の 450 bp フラグメントを配列決定する多座配列タイピング スキームとデータベースが開発されました。7 つの遺伝子座の対立遺伝子の組み合わせにより、配列タイプまたは対立遺伝子プロファイルが得られます。このタイピング スキームは、遺伝的関連性がわかっている肺炎球菌を使用して検証され、60 億を超える配列タイプを解決できました。多座配列タイピング スキームは、研究室間で電子的に移植可能な分子タイピング データを提供し、これらの生物の集団および進化生物学の側面を調査するために使用できるため、肺炎球菌の特性評価に強力な新しいアプローチを提供します。このプロジェクトでは、S.pneumoniae の 2 つの異なる株を比較して、どちらが急速に増殖しているかを確認し、表現型と遺伝子型に基づいて侵入株と非侵入株の違いを観察しました。