ニハン・ウヌボル、スレイマン・セリム・シナログル、メルベ・アシケル・エルマス、スメイエ・アクチェリク、アルズ・トゥグバ・オザル・イルデニズ、セラプ・アルバク、アディル・アラヴェルディエフ、タニル・コジャゴス
抗菌ペプチドは、感染症の治療に広く好まれている薬剤です。天然の抗菌ペプチドからヒントを得て、本研究では優れた抗菌活性を示す短いペプチドを設計しました。ペプチドは、αヘリックスの片側に配置された疎水性および正に帯電したアミノ酸の繰り返しで構成されていました。ペプチド中のアルギニンは、リジンに比べて優れた活性を示しました。両端に正に帯電したアミノ酸を持つことで、黄色ブドウ球菌に比べて大腸菌の活性が向上し、片側のみでは、両方の生物に対して同等の活性が得られました。ジグザグ形で片側にアルギニンを配置すると、直線軸上に配置する場合と比較して活性が著しく増加しました。疎水性テールを長くすると自己結合が起こり、抗菌活性が失われました。分子動力学シミュレーションでは、単一分子が膜に親水性チャネルを作成できることが示唆されました。これらのペプチドで処理したブドウ球菌の電子顕微鏡検査では、細菌が半分に分裂することが明らかになりました。ドッキング研究により、ペプチドが主要なペプチドグリカン合成膜タンパク質であるグリコシルトランスフェラーゼに強く結合することが明らかになりました。これらのペプチドのユニークな構成と設計により、有望な抗菌活性が明らかになり、多剤耐性菌に有効な新しい抗菌化合物の開発につながる可能性があります。