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ジャーナルチラシ
概要
Rep-PCR と多座配列解析に基づく Xanthomonas campestris Pv. campestris レースの病原性と遺伝学的特性
プリヤンカ・シン・ラター、ディネシュ・シン、リチャ・ラグワンシ、ヤダヴァ・DK
Xanthomonas campestris pv. campestris (Pammel) Dowson (Xcc) は、世界中のアブラナ科植物の黒腐病の原因菌です。インドの 12 の農業気候地域から 75 の Xcc 分離株が収集され、レースの分布パターンと個体群の多様性が調べられました。7 つの標準判別アブラナ科植物に対する病原性反応に基づき、レース 1、4、および 6 が優勢であることがわかりました。病原性の多様性を評価するために、7 つのBrassicaおよび coeno 種を含む 41 の栽培品種のアブラナ科植物が、圃場条件下で人工的に接種されました。 Brassica juncea の栽培品種 (Pusa Bold、Varuna、Pusa Vijay、Pusa Mustard 21、Pusa Mustard 25) は Xcc のすべての株に対して耐性を示したが、Brassica olerecea の栽培品種 Pusa Ageti はレース 1 と 4 に対して耐性があることが判明した。これら 75 株の Xcc の遺伝的特徴付けは、rep-PCR (ERIC、REP、BOXPCR) とそれに続く系統解析を使用して行われた。Xcc の株は 50% の類似係数で 6 つのグループにクラスター化され、これらのグループのうち、レース 1、4、6 に属する 28 株の Xcc はグループ 5 にまとめられた。レース 1、4、6 を代表する 5 株の 16S rRNA、hrpF、efP 遺伝子の配列を、多座配列解析に使用した。 16S rRNA および hrpF 遺伝子の配列解析に基づくと、インドの株は株 Xcc ATCC 33913 (レース 3、英国) と非常に近縁であることが判明しましたが、efP 配列に基づくと、株レース 1 Xcc B100 (イタリア) およびレース 9 Xcc 8004 (英国) と近縁であることが判明しました。