石油および環境バイオテクノロジージャーナル

概要

金属汚染土壌で生育した Jatropha Curcas と Gossypium Hirsutum をスクリーニングするための RAPD-PCR プロトコルの最適化

ナラヤナン・マティヤザガンとデヴァラジャン・ナタラジャン

金属汚染土壌で育った2種類の植物（Jatropha curcasとGossypium hirsutum）をスクリーニングするために、ランダム増幅多型DNAポリメラーゼ連鎖反応（RAPD-PCR）プロトコルの最適化を実施しました。DNA抽出にはCTAB法を採用しましたが、RNA汚染物質を除去するために一晩RNase処理を行いました。単離したDNAをRAPD-PCR増幅に使用しました。信頼性の高い増幅のための最適条件では、より高い濃度のMgCl 2（3 mM）、プライマー（2.5 μM）、Taq DNAポリメラーゼ（1ユニット）、および3μlのテンプレートDNA（サンプル）と55°Cのアニーリング温度が必要です。これらの条件では、両方の植物種で再現性のある増幅産物が観察されました。