植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

チュニジアのブドウ園で2つのオパイン型プラスミドを持つアグロバクテリウム・ヴィティスが発生

サミール・チェビル、ラベブ・フェルシ、シンダ・チェネナウイ、エムナ・アブデラティフ、ジュゼッペ・デュランテ、エレナ・ザッキ、アリ・ロウマ、アハメド・ムリキ

チュニジア中心部のいくつかのブドウ園で採取された1年生および2年生ブドウ（Vitis vinifera L.）栽培品種の感染した木部組織から、DNAサンプル50個を回収した。pehA、virF、virD2遺伝子特異的プライマーの組み合わせによるマルチプレックスPCRアッセイを使用して株を区別したところ、ほぼすべての株から対応する断片が増幅され、オクトピンまたはノパリンのpTisを持つAgrobacterium v​​itisおよびA. tumefaciens株と、A. vitis vitopine株が明確に区別された。分離株は3つの主なグループに分けられ、第1グループはオクトピン型Tiプラスミド、第2グループはvitopine型Tiプラスミド、第3グループはオクトピン型およびvitopine型Tiプラスミドの両方を持っている。10の分離株のポリガラクツロナーゼ遺伝子配列は、以前にNCBI GenBankデータベースに保存されたA. vitisの配列と94～97%の同一性を示した。得られたヌクレオチド配列は、JX946285 から JX946294 までのアクセス番号で Genbank に提出されました。