細菌学および寄生虫学ジャーナル

概要

腸球菌/VREの分子型別

グイド・ヴェルナー

院内病原体としての発生頻度が増加し、全体的な医学的重要性が高まったため、エンテロコッカス・フェカリスおよびエンテロコッカス・フェシウムの菌株を特徴づけ、区別する需要が高まっています。利用可能な技術は、使いやすさ、コスト、人手、時間、研究室間および研究室内の結果の比較可能性と再現性、データの移植性、識別力において異なります。高度な分子技術によるアウトブレイクの分析には、長期間にわたる流行菌株の伝播を検出および追跡する方法とは異なる識別方法が必要です。後者は、エンテロコッカスのようにかなり柔軟なゲノムを示す細菌にとって特に重要です。リボタイピング
、PCR ベースのタイピング、パルスフィールドゲル電気泳動 (PFGE) におけるマクロ制限分析、増幅断片長多型 (AFLP)、複数遺伝子座可変数タンデムリピート分析 (MLVA)、マルチローカスシーケンスタイピング (MLST)、およびいくつかの専門的なアプローチ (耐性クラスタータイピング、プラスミドタイピング、次世代シーケンシング) を含む、(バンコマイシン耐性) 腸球菌のタイピングに一般的に使用される技術の価値と応用について説明します。