植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

ケニア西部の特定の野生イネ科植物におけるファイトプラズマ 16S rRNA 遺伝子の分子的決定と特性評価

アダム OJ、ミデガ CAO、ルノ S、カーン ZR

ケニア西部のファイトプラズマサブグループ16SrXIによって引き起こされるネピア矮小化（Ns）病により、無放牧システムでのネピアグラス（Pennisetum purpuruem）の生産量は、多くの小規模農家の畑で最大90％減少しました。ケニアの他のいくつかの野生草もファイトプラズマに感染している可能性があり、そうしないとネピア、他の重要な飼料、食用作物に重大な脅威となると仮定されています。そのため、本研究では、16SリボソームRNA（リボ核酸）遺伝子を使用して、ケニア西部の野生草に感染しているファイトプラズマ株を検出および特定するとともに、2011年10月と2012年1月にケニア西部のブンゴマ郡とブシア郡で実施された無作為横断調査中に収集された646の野生草サンプルでファイトプラズマを宿主とする野生草種を特定しようとしました。 DNA を抽出し、ネストポリメラーゼ反応 (nPCR) を使用してファイトプラズマを検出しました。感染したネイピア畑の近くで生育している 8 種のイネ科植物で、2 つのサブグループのファイトプラズマが検出されました。報告された 2 種のファイトプラズマのうち、Ns ファイトプラズマに関連するものは 1 種のみでした。ファイトプラズマ感染の割合と採取されたイネ科植物の間には強い関連性がありました (p = 0.001)。C. dactylon、D. scalarum、B. brizantha、pousage grass、および P. maximum は感染の割合が高く、ケニア西部に豊富に分布していたため、野生ファイトプラズマの宿主であると考えられていました。E. indica および C. ciliaris はほとんど分布しておらず、感染率は低かったです。調査場所ごとの感染の割合には統計的に有意な差がありました (p = 0.001)。ファイトプラズマ サブグループ 16SrXI と 16SrXIV は、ケニア西部の野生の草に分布する唯一のファイトプラズマ遺伝子型でした。ファイトプラズマ サブグループ 16SrXIV は主にC. dactylon と B. brizantha の草にのみ感染しますが、ファイトプラズマ サブグループ 16SrXI は広範囲に感染し、多数の野生の草に感染します。一般的に、ケニア西部にはファイトプラズマを宿す野生の草が多種多様です。これらの宿主草は Ns ファイトプラズマのリザーバーとして機能し、ケニア西部で Ns 病の蔓延率が高かった原因である可能性があります。