水産養殖研究開発ジャーナル

概要

オオハタ（Epinephelus Lanceolatus）のビテロゲニンの分子特性

オム AD *、シャリフ S、ジャスマニ S、ソン YY、ボロン AA

ビテロジェニン (Vtg) 遺伝子配列は、環境要因に適応したり生殖腺の発達に影響を与えたりする魚類の繁殖の指標として機能します。オオハタの Vtg ヌクレオチド配列は、バイオインフォマティクス ソフトウェアを使用して特徴付けられました。得られた Vtg DNA の推定アミノ酸配列 (13 種と比較) の相同性検索は、国立バイオテクノロジー情報センターの Web サイトを使用して実行されました。Clustal W 解析では、分子進化遺伝解析 MEGA バージョン 5.2.2 を使用して系統樹を構築しました。得られた Vtg 遺伝子配列を検証し、Vtg の構造と機能の関係を解明するために、オオハタと他の魚類の 3-D 構造の DELTA BLAST を使用しました。最大尤度 (ML) と近隣結合 (NJ) を使用した系統解析の結果、ツリー解析によって 2 つの分離されたツリー トポロジーが生成されました。この類似性 (0.015 距離マトリックス ビューアー) は、環境条件や生態条件が異なっていても、Vtg 遺伝子配列の点で密接に関連していました。一般的に、Epinephelus lanceolatus Vtg は進化的に Poecilia latipinna とより関連していることが示されました。Epinephelus lanceolatus は 4 つの主要ドメイン (Vitellogenin-N、DUF1943、DUF1944、VMD) を示し、Dicentrachus labrax にも同様に見られますが、Clarias macrochepalus、Catla catla、Danio rerio とは異なっていました。これは、淡水種の Vtg ドメインの特性が Vtg の VMD の存在によって制御されることを示しています。分子的アプローチを Giant Grouper に対して実行することで、魚の成長に対する分子的反応を理解し、卵の品質を向上させるために Vtg 生産を増やす可能性のある Giant Grouper の個体を特定できます。