幹細胞研究と治療のジャーナル

概要

間葉系間質細胞と血管形成：遺伝子発現プロファイルと促進経路

ロジャー・TA・ヴァン・ウィック

要約
目的: 造血細胞と間葉系間質細胞は、
発生学的細胞分化系統において内皮細胞と密接に関連しています。血管免疫学と血管形態形成における微小環境の病態生物学を研究するために、免疫ゲノムプロジェクト (ImmGen) の発現データで、
ヒトとマウスの血管異常に関与することが知られている遺伝因子を分析しました。方法: 血管系に関連する遺伝子リストを作成するために、診断未確定奇形標準症候群の画像と NCBI Online のMendelian Inheritance in Man データベースをマイニングしました。ImmGen データベースでこれらの遺伝子の発現シグネチャを調べました。Partek® Genomics Suite 6.6 を使用して、階層的クラスタリング分析を実行しました。次に、取得したクラスターを Ingenuity Pathway Analysis (IPA) 内で個別に調査しました。これらの結果に基づき、別のデータベースから採取した周皮細胞サンプルを用いて主成分分析 (PCA) を実行し、周皮細胞との関係を調査しました。結果: データベースクエリの結果、血管系に関連する 438 個の遺伝子の遺伝子リストが得られ、そのうち 384 個をImmGen データ セット内で調査することができました。階層的クラスタリングにより、5 つの異なるクラスターを特定し、そのうちの1 つは間葉系細胞株での発現に特有のものでした。次に、IPA を使用して、周皮細胞の機能に関連するさまざまな経路を見つけました。その後の周皮細胞サンプルを用いた PCA では、間葉系起源の特定の間質細胞との類似性が示され、周皮細胞とこれらの細胞タイプの間で血管遺伝子の共通の発現プロファイルが示されました。これらの結果は、上皮間葉転換や内皮間葉転換のプロセスが、血管形態形成における上皮細胞/内皮細胞と間葉系間質細胞との相互作用の根底にあることを示しています。結論: このデータ分析研究では、さまざまなソースからのデータ融合を実施しました。これは、研究設計や細胞タイプの選択における将来のメカニズムと治療の研究に役立つ可能性があり、血管異常に関連する特定の病理学的分子メカニズムに基づいて治療ターゲットを見つけるための潜在的な戦略を提供します。