ゲノミクスとプロテオミクスにおけるデータマイニングのジャーナル

概要

哺乳類グルタミルアミノペプチダーゼ遺伝子（ENPEP）とタンパク質：動脈性高血圧の主な原因の比較研究

ロジャー・S・ホームズ、キンバリー・D・スプラドリング・リーブス、ローラ・A・コックス

グルタミルアミノペプチダーゼ (ENPEP) は、哺乳類の II 型膜貫通型亜鉛含有エンドペプチダーゼである M1 ファミリーのエンドペプチダーゼのメンバーです。ENPEP は、血圧調節と血管形成に関与するアンジオテンシン III を形成するレニンアンジオテンシン系の異化経路に関与しています。いくつかの哺乳類ゲノム プロジェクトのデータを使用して、比較 ENPEP アミノ酸配列と構造、および ENPEP 遺伝子の位置を調べました。哺乳類 ENPEP 配列は 71 ～ 98% の同一性を共有していました。5 つの N グリコシル化部位は、調べたすべての哺乳類 ENPEP タンパク質で保存されていましたが、各ケースで 9 ～ 18 の部位が観察されました。膜貫通配列と細胞質配列、および活性部位残基を含む、配列アラインメント、主要なアミノ酸残基、および予測される二次構造と三次構造も研究されました。哺乳類の ENPEP 遺伝子には 20 個のコーディング エクソンが含まれています。ヒトの ENPEP 遺伝子プロモーターと最初のコーディング エクソンには CpG アイランド (CpG27) と少なくとも 6 つの転写因子結合部位が含まれていますが、3'-UTR 領域には 7 つの miRNA ターゲット サイトが含まれており、これが体の組織における ENPEP 遺伝子発現の調節に寄与している可能性があります。系統発生解析では、比較のためにニワトリの ENPEP を原始配列として使用し、霊長類、その他の真獣類、有袋類、単孔類を含む哺乳類の ENPEP 遺伝子とタンパク質の関係を調べました。