ゲノミクスとプロテオミクスにおけるデータマイニングのジャーナル

概要

薬剤反応モデリングのためのリンパ芽球細胞株の活用

アリソン A モッツィンガー-ライフ1,2 およびダニエル M ロトロフ1,2*

リンパ芽球様細胞株 (LCL) は、薬物反応をモデル化するための一般的なツールになりつつあります。LCL やその他の in vitro アッセイは、多くの薬物、用量、および生物学的サンプルを比較的迅速かつ安価にテストする機能を提供します。さらに、LCL の独自の利点は、大規模な個人コホートから入手できるため、他の in vitro システムでは容易に利用できない規模で遺伝的変異をテストできることです。多くの場合、遺伝子型データは公開されているため、実験コストは薬物反応表現型のコストに限定できます。ここでは、LCL のいくつかの利点と制限について説明します。さらに、LCL の実験設計と統計分析のいくつかの重要な側面についても説明します。最後に、慢性骨髄性白血病の治療に使用される化学療法に対する反応の変異の候補となる一塩基多型と遺伝子を特定するために LCL が効果的に使用されている例を示します。