植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

Phytophthora cinnamomi の細胞骨格形成に関与する Actin1、Actin2、Tubulin1 遺伝子の単離と配列決定

イヴォン・M・マルティンス、M・カルメン・ロペス、アンヘル・ドミンゲス、アルティノ・シュピナ

Phytophthora属の卵菌類は、農業や自然生態系に壊滅的な被害を与える真菌様植物病原体です。ノルデステ・トランスモンターノ地域 (ポルトガル北東部) では、Castanea sativa クリ栽培が極めて重要です。生産性と収量に最も大きな打撃を与えるのは、 Phytophthora cinnamomiによって引き起こされるインク病です。Phytophthora cinnamomi は最も広く分布するPhytophthora属の 1 つで、宿主種は 1,000 種近くに上ります。病原性の原因となる分子メカニズムに関する知識は、この病原体の関連疾患と闘うための重要なツールです。P. cinnamomi の細胞骨格形成に関与する act1、act2、tub1 遺伝子の完全なオープンリーディングフレーム (ORF) は、高効率熱非対称インターレース (HE-TAIL) ポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) によって得られました。 act1 遺伝子は 1128 bp の ORF から成り、375 アミノ酸 (aa) と 41,972 kDa の推定タンパク質をコードします。act2 ORF は 1083 bp から成り、360 aa と 40,237 kDa の推定タンパク質をコードします。tub1 は全長 2263 bp で、分子量 49.911 kDa の 453 aa タンパク質をコードします。バイオインフォマティクス解析により、actin1 は Phytophthora infestans、Phytophthora megasperma、および Phytophthora melonis の act1 遺伝子の相同遺伝子であることが示されています。 actin2 はP. infestans、Phytophthora brassicae、P. melonis、およびPythium splendensの act2 遺伝子と相同遺伝子であり、tubulin1 はP. infestansおよびP. capsici の α -tubulin 遺伝子と最も高い相同性を示します。3
つの推定タンパク質の 3D 構造を解析したところ、X 線回折によって得られた相同タンパク質について記述されたものと非常に類似した空間構造が明らかになりました。