水産養殖研究開発ジャーナル

概要

国際ラムサール条約湿地である東コルカタ湿地から分離された硝化細菌の 16S rRNA 遺伝子配列と amoA および nxrA との比較分析を確立するための導入

サハ M、サーカール A、バンドファディヤイ B

窒素循環は地球上の生命にとって最も複雑かつ重要です。窒素循環プロセスを実行する硝化細菌は水質管理において重要な役割を果たしているため、硝化細菌の遺伝的変異の監視とモニタリングのためのゲノム指紋データベースを作成することは非常に重要です。また、西ベンガルのさまざまな地域にあるベリーのバイオセキュリティプロトコルを確立することも重要です。アンモニア酸化細菌 (AOB) と亜硝酸酸化細菌 (NOB) の現在の進化関係と自然多様性は、主に東コルカタ湿地のアンモニアモノオキシゲナーゼ (AmoA) と亜硝酸酸化還元酵素 (NxrA) の活性部位ポリペプチドと 16S rRNA をコードする遺伝子の比較配列分析に基づいています。この研究により、AOB の 16S rRNA と amoA データベース、NOB の nxrA データベースが大幅に拡張されました。したがって、機能マーカー（amoA または nxrA）のいずれかを使用してアンモニア酸化剤を追跡したり、構造マーカー（16S rDNA）を使用して環境研究で特定の種を追跡したりできます。これらの技術には、16S rDNA 遺伝子を使用して天然の AOB および NOB 集団を特徴付け、それらの分類学的および系統学的特徴を分析することが含まれます。比較 16S rRNA 配列分析によって確立された AOB および NOB 系統発生の現在の認識は、遺伝子 amoA および nxrA を利用することで個別に確認でき、代替系統発生マーカーとして証明されました。私たちの研究の目的は、EKW での 16S rDNA 配列分析とともに、AOB および NOB の機能マーカーとしてのアンモニアモノオキシゲナーゼサブユニット A 遺伝子（amoA）と亜硝酸酸化還元酵素（nxrA）遺伝子の可能性を調査することです。生態学的監視においては、現在研究中の硝化細菌に特有の amoA や nxrA などの遺伝子がより信頼性の高いツールとなる可能性があります。