微生物および生化学技術ジャーナル

概要

Flavobacterium Columnare における gtf、norB、trx 遺伝子の同定と特性評価

インフェン・チャンとコバドンガ・R・アリアス

Flavobacterium columnare の毒性株 ALG-00-530 のショットガンゲノムライブラリから 3 つの遺伝子が同定され、特徴付けられ、関連種の推定毒性遺伝子との配列類似性に基づいて差次的発現解析のために選択されました。これらの遺伝子は、グリコシルトランスフェラーゼ (gtf)、一酸化窒素還元酵素 (norB)、およびチオレドキシン (trx) でした。ジェノモヴァール I および II の株を含む 30 の F. columnare 株のコレクションで、これらの遺伝子の存在が検査されました。種全体にわたる gtf、norB、および trx の分布パターンは均一ではありませんでした。各遺伝子についてジェノモヴァール間でヌクレオチド配列の変異が観察されましたが、同じジェノモヴァール内の株は同一の遺伝子配列を共有していました。両方のジェノモヴァールから 9 つの F. columnare 株が遺伝子発現解析のために選択されました。毒性の強い菌株である ALG-00-530 は、標準的な生育条件、鉄分制限条件、およびアメリカナマズの皮膚組織片の存在下での遺伝子発現の比較のために選択されました。ALG-00-530 を異なる条件下で培養すると、NorB および trx 遺伝子発現レベルは変化しました。