薬理ゲノミクスと薬理プロテオミクスのジャーナル

概要

細菌プラスミド pMAL-C2X に基づく自家製 100 ペア ベース DNA ラダー

フィルゼ・バドレ 1、コダカラム・ジャハンビン 2、アリ・コダダディ 2、アリ・ホラーサニ・ザデ 2、ムーサ・シャリファト 2、ミラド・カヤティ 2、モハマド・ラシュノ 2、3

背景:ほとんどの分子生物学研究成果では、日常業務で電気泳動によって核酸断片の長さを検出し定量化するために、DNA ラダーなどのマーカーが必要です。

方法:本研究では、PCR 技術に基づいて 100 対塩基の DNA ラダーを調製する方法を報告します。細菌プラスミド pMAL-C2X を PCR のテンプレート DNA として使用しました。PCR 産物はフェノール/クロロホルムで抽出し、エタノールで沈殿させて比例混合しました。

結果:最終的に、7 つのプライマー セット (リバース 5 つとフォワード 2 つ) が正常に設計されました。増幅された PCR フラグメントはナノドロップによって定量化され、バンド サイズは、1.5% アガロース ゲルで共移動する市販の 100 bp ラダーとともにゲル電気泳動によって推定されました。結果は、PCR の 1 回の反応で 100 bp ～ 1000 bp の鮮明でシャープなバンドが正常に生成されたことを示しています。

結論:当社の自家製製品は商業市場と競争力のある製品であり、シンプルで安価な方法で製造でき、非特異的バンドの可能性は低いです。