生物学と医学

概要

大腸がんに関連する DNA メチル化マーカーの GLAD-PCR アッセイ

アレクセイ・A・エフドキモフ、ニーナ・A・ネテソワ、ナタリア・A・スメタニコワ、ムラト・A・アブドゥラシトフ、アレクサンドル・G・アキシェフ、ボリス・S・マリシェフ、エフゲニヤ・S・ダビドヴィッチ、ウラジミール・V・フェドトフ、ヴィタリー・V・クズネツォフ、ユーリー・デルモラエフ、アンドレイ・B・カルポフ、アレクセイ・E・サゾノフ、ラヴィル・Mタハウフとセルゲイ・K・デグチャレフ

遺伝子調節領域の過剰メチル化は、多くの癌疾患で記録されています。癌細胞におけるこのような異常な DNA メチル化は、主に RCGY 配列を認識してメチル化し、R(5mC)GY 部位を形成する DNA メチルトランスフェラーゼ Dnmt3a および Dnmt3b によって触媒されます。最近、新しいメチル指向性 DNA エンドヌクレアーゼ GlaI に基づいて、ゲノム DNA の特定の位置にある R(5mC)GY 部位を決定できる GLAD-PCR アッセイを開発しました。この研究では、大腸癌 (CRC) に関連するダウンレギュレーション遺伝子の調節領域にあるメチル化された RCGY 部位の特定に GLAD-PCR アッセイを適用しました。このリストには、ADHFE1、ALX4、CNRIP1、EID3、ELMO1、ESR1、FBN1、HLTF、LAMA1、NEUROG1、NGFR、RARB、RXRG、RYR2、SDC2、SEPT9、SFRP2、SOCS3、SOX17、THBD、TMEFF2、UCHL1、および VIM 遺伝子が含まれています。これらの遺伝子の一部の制御領域内の選択された RCGY 部位の GLAD-PCR 分析では、腫瘍 DNA における CRC 検出の感度と特異性が比較的高く、良好な予後の可能性を示しています。